Основоположник теории биогеохимических провинций.

На основе представлений о биогеохимических провинций В. В. Ковальским была создана система биогеохимического районирования территории СССР (1958—1964). При изучении биогеохимических провинций были открыты новые эндемии (эндемические болезни) животных и растений.