В XV веке на территорию современного Казахстана начали проникать ойраты — западномонгольский народ, недавно основавший собственное государство. Желая расширить территории своих кочевий за счёт Центральной Азии, ойраты стремились взять под свой контроль торговые пути и захватить оседло-земледельческие оазисы в Семиречье. В середине XV века произошло несколько сражений между ойратами и казахами под руководством Керей-хана и Жанибек-хана. В книге «Удивительные события» позднесредневекового таджикского писателя Васифи в первой половине XVI века, во время правления Тахир-хана, для обороны от набегов ойратов в была построена крепость Джатан (или Джашан, подтвердить факт существования крепости и её расположение современной науке не удалось). В конце XVI века Тауекель-хан нанёс ойратам ряд крупных поражений и подчинил часть их родов. Однако ослабление Казахского ханства из-за внутренних распрей обусловило укрепление позиций нового государства — Джунгарского ханства, основанного в XVII веке «левым крылом» ойратских племён (западной частью ойратов)