Во второй половине 1920-х годов в СССР началась массированная атака на религию. Утверждение тоталитарной системы к концу 1920-х годов вызвало к жизни беспрецедентную кампанию против религиозных организаций и священнослужителей, которые рассматривались как политические объекты. Органами ОГПУ проводились различные негласные мероприятия для предотвращения объединения мусульман страны, с одной стороны, по линии конфессионального объединения, и с другой, политической консолидации духовенства и национальной интеллигенции. Большевики принимали решения о регистрации и снятии с регистрации религиозных объединений, об открытии и закрытии мечетей, осуществляли контроль за соблюдением законодательства о культах. Этот порядок привело ограничению и ущемлению их гражданских прав, начался грубый административный контроль над всей религиозной деятельностью страны. Мусульманство пострадало больше остальных религии, потому что власти провели грандиозный эксперимент по замене арабского алфавита с начала на латиницу, затем на кириллицу. Реформа алфавита нанесла потрясающий урон авторитету ислама, подорвало духовные устои и нравственные ценности мусульманского общества. Подавлялась любая форма сопративления. Запрет мусульманских религиозных организаций, преследование и физическое уничтожение мулл и имамов, закрытие мечетей подорвали организционно-мобилизационную базу ислама в Казахстане. Изменившийся образ жизни казахов способствовал размыванию религиозных традиций и формированию атеистического мировозрения казахского населения.