вписываю в пропуски по порядку:
2-3 Санитарное состояние самих городов. . .
2-3 мусором, который выбрасывался на мостовую из домов. . .
4 . . . большое число беженцев, высокая плотность населения способствовали быстрому распространению. . .
5 Сами горожане не соблюдали элементарные правила личной гигиены.
6 . . . огромное количество крыс с кораблей. . .